Date de début
Contenu
Organisation de la formation
Partie théorique (6h)
Recherche d’homologues à bas taux d’identité :
notion de profils, similitude locale. Méthodes de reconnaissance de repliement
Notions de prédiction de novo : structure 3D et combinaison de fragments. Limites et possibilités
Evaluation des modèles : descripteurs et méthodologie
Partie pratique (24h)
Construction de différents modèles structuraux. Utilisation de différents meta-serveurs. Intégration de données biologiques.
Evaluation et Analyse critique des résultats
du 28 au 31 mai 2018
4 jours / 30 heures
2050 €
(TVA 0% incluse)
Public Cible
Prérequis
Techniciens, ingénieurs et chercheurs des entreprises et des collectivités dans le domaine des sciences du vivant.
Pré-requis
Connaissance de base en comparaison de séquences et structures 3D des protéines. La connaissance de l’environnement Unix/Linux est recommandée.
Droits de scolarité
2050 €
Compétences visées
De nombreuses séquences s’avèrent extrêmement délicates à prédire d’un point de vue structural en raison de l’absence d’homologues structuraux détectables. La compétence visée sera d’être capable de construire un modèle structural pertinent d’une protéine dans un tel cas. Il s’agira donc d’appréhender les concepts des méthodes de modélisation à bas taux d’identité et de maîtriser les outils utilisables sur le WEB ou localement.
Outre les connaissances théoriques, l’accent sera mis sur des cas pratiques de difficultés croissantes.
Seront ainsi abordées les approches de reconnaissance de repliement et de prédiction de novo. Un point crucial résidera dans l’évaluation des modèles et en particulier via l’utilisation des descripteurs caractéristiques des structures protéiques.
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